除去隐孢子虫、贾第鞭毛虫两种病原体，在我们饮用水中还存在以下一些致病微生物：

1、卷曲鱼腥藻
  
卷曲鱼腥藻里有一种蓝绿菌，这种蓝绿菌遍布在全世界的淡水水库里，蓝菌在地球上已存在约30亿年，是目前以来发现到的最早的光合放氧生物，对地球表面从无氧的大气环境变为有氧环境起了巨大的作用。有纪录证明饮用或于被蓝菌污染的水源接触会引致中毒现象，但实际多少的摄取量会致命则未有定论。
 
2、鸟分枝杆菌副结核亚种
  
这种细菌可以在15%的家畜中找到，并可造成肠道炎症，由于农场废水排放，最终会流到我们的淡水中，这种细菌特别难以杀死，它能够造成消化系统中从嘴巴到脚任何部位的炎症。
 
3、肠道沙门氏菌
  
肠炎沙门氏菌属于无宿主特异性而有侵害性的病原菌之一，宿主包括人和各种动物。该菌不仅能引起家禽发病死亡造成严重的经济损失，而且被污染的家禽产品作为肠炎沙门氏菌的携带者，还严重危害人类健康。
 
4、摇蚊属生物
  
这些小蚊子不会在你的水里游泳，但是幼虫会，这些赤虫的幼虫不怕辐射和干晒。等它们补水或是从辐射影响下恢复后，可以自我修复，原地满血复活。如果觉得大口喝赤虫还不够恶心，你还有可能喝下摇蚊卵。
 
5、桡脚类
 
很多淡水桡脚类都是生活在地底下的，如洞穴、水坑或河床等。桡脚类有时会在供水系统中出现，尤其是没有过滤的供水。在已处理的供水系统中并不怎么有问题，但在如秘鲁及孟加拉等热带国家，就发现桡脚类与通过未经处理的供水传播的霍乱有关，而霍乱菌正是附在浮游生物的表面。
 
6、嗜肺军团菌
  
嗜肺军团菌是一种细胞兼性寄生的细菌，可入侵变形虫，或是人类的巨噬细胞内。该菌的感染力在抗体和血清补体存在下大大提高。该菌会因噬菌作用被伪足包裹进入巨噬细胞，之后，菌体被细胞产生的自噬体包裹起来，这却阻止了溶酶体的溶解。每年都会把18000人送进医院。
 
7、曲状杆菌
  
曲状杆菌曾经是世界上最大的食物中毒元凶，它经常在被污染的鸡肉中被发现，会导致带血腹泻、痢疾和发烧，虽然它很容易被杀死，但是如果饮用水没有被妥善氯化过，还是会导致疫情爆发。
 
8、大肠杆菌
  
大肠杆菌是人和许多动物肠道中最主要且数量最多的一种细菌，周身鞭毛，能运动，无芽孢。主要生活在大肠内。正常情况下，大多数大肠杆菌是非常安分守己的，他们能竞争性抵御致病菌的进攻，只有在机体免疫力降低、肠道长期缺乏刺激等特殊情况下，这些平日里的良民才会兴风作浪，移居到肠道以外的地方进行感染。
 
9、福氏耐格里变形虫
  
福氏耐格里变形虫是一种阿米巴原虫，主要分为寄生和自由生活的两大类。寄生于人体内的阿米巴原虫能引起阿米巴痢疾，有时也可引起肝脓肿、肺脓肿和脑膜炎。自由生活的阿米巴原虫包括棘阿米巴属、纳格里属、哈氏变形虫属和瓦氏变形虫属等，其中许多可以导致人类疾病。